2002年，外科学（神外）国家教育部评为国家重点学科，2004年成为国家继续医学（神经外科）教育基地。该学科依托九州平台-九州(中国)集团有限公司神经外科学院进行建设。
　　神经外科学院是世界卫生组织（WHO）在中国神经外科培训中心，为亚洲规模最大的神经外科临床、科研和教学基地，与加拿大蒙特利尔医学院、德国洪堡大学医学院、美国德州大学医学院（Medical School at Houston, University of TX ）、约翰霍普金斯大学医院（ Johns Hopkins University Hospital ）联合培养研究生，合作开展脑血管病及脑胶质瘤的基础研究。神经外科学院是中华医学会和中国医师学会神经外科分会前主委、世界神经外科联盟（WFNS）执委单位，担任World Neurosurgery（美）、Neurosurgical Review和J. of Clinical Neurosurgery 等国际杂志编委。

中国工程院院士、神经外科学院院长王忠诚获得2008年度国家最高科技奖，国家主席胡锦涛与其亲切握手表示祝贺	研究成果获国家科技进步奖

　　学科现有医师359人，其中国家级有突出贡献专家3名，教授94人，副教授114人，有博士学位者231人。博士生导师23人，硕士生导师36人，博士后流动站3个。近五年期间新增博士生导师16人，硕士生导师24人，累计招收硕士研究生187人，博士研究生99人，博士后12人。
　　学科承担着学校五年、七年制、口腔学院的日常教学工作。主编出版卫生部研究生规划教材、全国高等学校《神经外科学》教材及其配套实习手册，担任人民卫生出版社5年、7年、8年制全国高等学校和卫生部规划教材《外科学》和高等教育出版社《外科学》神经外科学分编负责人。
　　主要研究方向为脑血管病临床治疗和基础研究；神经系统肿瘤的基础与临床研究；功能神经外科的基础与临床研究；血管内介入治疗研究；微创神经外科技术的研究、开发和推广应用；中枢神经系统损伤代偿修复的机制和促进修复方法的研究；脑血管病的防治研究；重要神经系统疾病的病因学及人群防止措施的研究等。学院在国内率先建立微创神经外科技术平台、在微创技术、脑血管和颅脑肿瘤的外科治疗达到国际先进水平，部分技术处于国际领先。开设颅脑损伤、肿瘤、脑血管病，脊髓脊柱，神经功能和小儿神经外科等专业组。圆满完成奥运的医疗保障和国内重大突发事件的医疗救治工作。依靠神经外科学院科学优势，集神经内、外科，神经放射和神经科学等学科建立脑血管病中心和脑卒中绿色通道，以转化医学理念，形成临床-教学-科研一体化模式。
　　学科自承担国家脑血管科技攻关（支撑）和北京市脑血管病防治重大项目，在全国和北京市建立脑血管病外科治疗平台和防治网络。目前承担国家重大支撑项目有“脑卒中外科综合治疗技术体系研究”，“蛛网膜下腔出血与脑动脉瘤诊断与治疗的规范”和“脑、脊髓动静脉畸形多种微创治疗技术及预后因素分析”，国家自然基金委重点项目“功能磁共振成像和神经导航的微创神经外科学研究”和973项目“认知基本单元的实验范式和心理病理学结合”重大科研项目。
　　2008年王忠诚院士获得国家最高科学技术奖，2005年“脑血管畸形的外科治疗及其形成和破裂出血的机制研究”和2009年“颅脑手术中脑认知功能保护的微创神经外科学基础研究与临床应用”获国家科技进步二等奖，同年“出血性脑卒中规范化外科技术推广及机制和临床预测研究”获教育部科技进步二等奖，申请专利4 项奖。曾在美国 AANS 大会“Surgical Management of Hypertensive Intracerebral Hemorrhage in 2464 cases”获国际论文奖。

　　学科将继续坚持以科学发展观为指导，坚持学科发展为基础的理念，坚持教研并重的基本原则，遵循学科发展的基本规律，注重经济社会的主要需求，以人才队伍建设为核心，以开拓创新为动力，坚持实事求是和勇于发展的精神，抓住机遇，争取资源，不懈努力，奠定转化医学的发展基础，推进神经外科学科水平的整体提高，为学科发展新一轮冲击做好储备。