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学系十分重视教育教学人才培养。目前承担着专升本、本科、硕士、博士、国际学院外国留学生的外科学总论及普通外科各论的教学工作。目前学系内有博士生导师12名，硕士生导师20余名。培养博士60余人，培养硕士研究生300余人。普通外科学系与英国卡迪夫大学等多家大学、中心建立学术往来，并派出年轻医生进行交流，取得较好效果。在科研上，目前学系承担国家级科研项目11项，省部级科研项目30余项，近2年发表核心期刊390余篇，主编专著10余部。
学系注重社会服务定位，深入基层，服务基层，学系各单位均有基层联系单位，定期为基层单位会诊，解决实际问题，得到基层医院好评。另外，学系注重对外学术交流，每年均有大量人员参加国内外有影响的会议，如ASCO会议等。学系坚持“走出去，请进来”的原则，邀请国际、国内知名专家到学系讲座。成员单位有国家级学习班、论坛等。
普通外科学系将继续贯彻“发扬优势、突出重点、加强应用”的学科建设方针，抓住机遇，争取资源。在建设过程中要充分注意到人才培养、科学研究和社会服务三大功能的全面发展。在学科建设过程中，注重人才队伍建设，着力加强人才引进与培养，实现学科人才队伍建设的可持续发展。在学科建设过程中，要认真利用好已有的国家消化系统疾病临床医学研究中心、国家临床重点专科、北京市医院管理局重点专业、移植免疫耐受北京市重点实验室等平台。进一步整合学科资源，认真做好疾病临床数据和样本资源库的建设，强化医学成果转化。在学科建设过程中，结合广大人民群众的发展需求，持续深入地开展临床重大课题研究，全面提高学校学科社会服务的能力和水平。全面推进学科的国际国内合作与交流，拓展学科建设的视野，扩大学科的社会影响力，力争在“十三五”末扩大学科的社会知名度，争取在全国医院专科名列前茅。
