在中华医学会消化专业的三个主要学会-消化病学分会、消化内镜分会、肝病学分会中，老一代的专家王宝恩教授和于中麟教授曾经在1985-1998年先后担任过三个学会的主任委员，王宝恩教授还创立了中华医学会肝病学分会。学系主任张澍田教授担任中华医学会消化内镜分会候任主任委员、中华医学会消化病学分会副主任委员、中国医师协会消化医师分会副会长兼总干事、中国医促会胃病专业委员会副会长、常务理事、中华医学会北京分会消化病委员会副主任委员、中华医学会北京分会消化内镜专业委员会副主任委员等。学系副主任贾继东教授现任中华医学会肝病分会主任委员、兼任国际肝病学会（IASL）副主席、2009－2010担任亚太肝病学会（APASL）主席、中华医学会临床药学分会副主任委员、中国免疫学会感染免疫分会副主任委员、中国医师协会消化医师分会执行委员、中国中西医结合学会肝病专业委员会副主任委员、中国肝炎防治基金会副理事长等。新老学术带头人在国内和国际都具有较强的学术影响力。

　　消化病学系将坚持策略前移、重心下移，坚持预防为主、促进健康和防治疾病结合的国家肿瘤、慢性疾病防治原则，响应“精准治疗”号召，建立消化系统重大疾病预警、预防、早期精准诊治的全链条研究框架。进一步凝炼研究方向，优化学科布局，契合首都科技发展需求。进一步创新、引进、推广消化内镜介入（微创）治疗技术、完善诊疗规范。加强临床医疗、教学、科研、培训、社会服务一体化建设，本学科达到国际先进水平。进一步加快消化系癌前病变基础研究向临床应用的转化。进一步加强骨干人才培养，提高团队科研及创新能力，进一步加强医院之间的横向联系，加强与国内外知名高校、企业的合作，建立产学研防合作模式。通过不懈努力提升学系综合实力及国际竞争力。